とりあえず普通にできたので。
クリーンインストールがよいみたいです。
こうも短期間で設定しなおすのも面倒ですが…。

Prerooted.236作成→その後deodex化

a)D5503_14.6.A.1.236(Customized UK)prerooted
b)JoelDroidLollipopBatchDeodexer2.5にてdeodex化
　systemファイルの抽出方法を変えてみる
　Xperia Z1 / Z1C 5.1.1(.216) DEODEX Patch + SuperUser Mode
　（#23にTODO有）
　今回は端末本体から抜き出さないで、ftf fileからsystem.sin取り出す。
　Flashtools - > Tools -> Sin Editor
　system.ext4をext2exploreにて保存 - >必要なフォルダのみ残す。
　（.ext4が解凍できればいいのでLinux Readerでok）
　①app
　②framework - >SemcGenericUxpResフォルダをpriv-appに移動
　③priv-app
　④vendor - > app - > ChromeCustomizationsとimsフォルダを
　　　priv-appに移動。これでdeodex化。
　当然super su無いので、216でdeodexから入れておく。
　↑ちなみに、Xperia Z1 / Z1C 5.1.1 DEODEX Patchの.zip内systemを
　差し替えてdeodexしたので…こうなりました…(^^;;;。
　②と④で移動したフォルダを元に戻す。

deodexインストール後の起動で、マップが終了、googleドライブが変な挙動を
しているので再インストールか更新すれば問題なし？

14.6.A.1.236 deodex化できたもの

ついでに14.6.A.1.236 CPUガバナとIOスケジューラモジュール